Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms