Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl2P10148 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms