Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ifnb1P01575 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ifnb1P01575 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ifnb1P01575 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ifnb1P01575 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms