Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms