Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Eftud2O08810 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms