Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm5458L7N219 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5458L7N219 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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