Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm933J3QPC1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm933J3QPC1 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm933J3QPC1 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms