Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmem200cJ3QK46 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms