Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
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Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cldn34c3J3QJW5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cldn34c3J3QJW5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms