Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vmn1r58G3X9U3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms