Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rnf217D3YYI7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms