Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SafbD3YXK2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms