Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cttnbp2B9EJA2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms