Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms