Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms