Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Grik3B1AS29 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms