Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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