Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ttll9A2APC3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ttll9A2APC3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms