Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms