Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Speer3W4VSP1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms