Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3Q9Z2D8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms