Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cldn8Q9Z260 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms