Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rdh11Q9QYF1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms