Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms