Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gde1Q9JL56 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gde1Q9JL56 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms