Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ybx3Q9JKB3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms