Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zcchc17Q9ESX4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zcchc17Q9ESX4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms