Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp29Q9ES63 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp29Q9ES63 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms