Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Syde1Q9DBZ9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Syde1Q9DBZ9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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