Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gm10229-201ENSMUST00000089106 570 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms