Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms