Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Trappc6bQ9D289 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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