Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmbr1lQ9D1E5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms