Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gins3Q9CY94 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms