Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms