Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pard3bQ9CSB4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pard3bQ9CSB4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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