Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ykt6Q9CQW1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms