Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim8Q9CQQ0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim8Q9CQQ0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms