Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms