Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Use1Q9CQ56 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Use1Q9CQ56 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms