Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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