Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NsmfQ99NF2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms