Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms