Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tdrd1Q99MV1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tdrd1Q99MV1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms