Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd1bQ99JY6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms