Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Snx18Q91ZR2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx18Q91ZR2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms