Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc8Q8VD72 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms