Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Vrk3Q8K3G5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Vrk3Q8K3G5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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