Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrrtm1Q8K377 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrrtm1Q8K377 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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