Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms